De producten in het assortiment van de Natuurwinkel stralen respect voor natuur en milieu uit, zegt Koetsier. De bedrijfsvoering moet dat ook gaan uitstralen. De keten is de eerste die duurzaam ondernemen een peiler onder de formule maakt. De Natuur Winkel Organisatie (NWO) heeft 50 franchisenemers, die vanaf volgend jaar aan de nieuwe eisen moeten voldoen. De Franchiseraad van de keten heeft daarmee ingestemd.
De Natuurwinkel gaat alleen groene energie gebruiken en het energiegebruik zoveel mogelijk inperken. Het lichtplan wordt energiezuiniger, de koelingen worden afgesloten met deurtjes en er worden alleen nog milieuvriendelijke schoonmaakmiddelen gebruikt. De verpakkingsmaterialen die de Natuurwinkels gaan gebruiken zijn volledig afbreekbaar of te recyclen. Bedrijfskleding wordt biologisch geproduceerd uit natuurlijke materialen.